认定机构收到的评价意见和中介机构的专项审计报告后，对申请企业提出认定意见，并确定高新技术企业认定名单。
企业申请认定时须注册成立一年以上（“须注册成立一年以上”是指企业须注册成立365个日历天数以上，而非一个会计年度）。
研发组织管理水平证明材料，主要包括研发项目立项管理、研发投入核算体系、研发机构建设及设备设施、开展产学研合作活动、研发人员考核制度等方面；技术创新活动的其他证明材料。

在高新技术企业认定过程中所指的企业总收入也是有一定界定的，指的是企业的收入总额减去不征税的收入，具体按照国家相关法律法规的规定计算。
在提交《高新认定申请书》前企业必须认真核查5份审计报告数据和申报系统中提交的数据的一致性，如果对不上要及时处理更正不然会不予通过。
鼓励企业吸引人才，建立研发机构，高新企业认定费用，建立健全研发组织管理制度，加大研发投入，申请高新企业认定，引导企业自主研发创新，申报高新企业认定，拥有相应的知识产权所有权，六安高新企业认定，提升企业技术创新能力和创新水平。

在提交《高新认定申请书》前企业必须认真核查5份审计报告数据和申报系统中提交的数据的一致性，如果对不上要及时处理更正不然会不予通过。
很多科技项目都需要在具备高新技术企业资质的基础上申报。
如中小企业科技扶持资金等项目类；如工程技术研究中心等认定类。
在高新技术企业认定过程中要求企业技术产品或者服务的收入占企业总收入的60%，这里的收入当然不是说都是产品的收入，还有其他的跟技术或者知识产权的收入也算在其中。

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